Но вот пришло время со знатоком геральдики, фарфора и вееров разобраться, и в 1927 году Тройницкий был снят с высокой должности директора, в преддверии начала реализации программы распродаж сокровищ Эрмитажа, в том числе на аукционе в Германии (определено к продаже около 2500 картин, продано около 800 полотен)
2). В 1931 году Сергей Николаевич наконец получил в большевистской «Красной газетке» и высокое звание
«пожалуй, самого опасного вредителя в Эрмитаже», а 18 апреля 1931 года на заседании Комиссии Эрмитажа по чистке — «очищен» по 1-й категории, что было по рассмотрению апелляции смягчено до 3-й категории, позволявшей всё же
быть на этом свете и тихонько служить в Эрмитаже. Но уже 28 февраля 1935 года Сергей Николаевич арестован в ходе Операции НКВД «Бывшие люди» и незамедлительно сослан в Уфу. При этом чекисты строго проигнорировали умильную просьбу со стороны Конторы «Антиквариат», превратившего залы Эрмитажа в магазин для иностранных гостей, не высылать Тройницкого ввиду его особой ценности как буржуазного специалиста. Но, слава богу, что бывший директор Эрмитажа и основатель журнала «Старые Годы» избежал пули и ямы на пустыре, в отличие от своего единомышленника, знаменитого издателя и редактора журнала «Старые Годы», создателя «Музея Старого Петербурга» П. П. Вейнера, пристрелянного верными делу Ленина упырями 7 января 1931 года лежащим на земле, поскольку не мог великий деятель искусства, приговорённый к смерти, ходить и стоять на ногах из-за тяжелой болезни.